Действие фильма разворачивается в 1964 году, в разгар общественных потрясений, связанных с борьбой за права чернокожего населения в США. 14-летняя Лили Оуэнс живет с отцом, который регулярно издевается над ней, а единственное сокровище, которое у нее осталось от умершей матери — это деревянная фигурка Марии с надписью «Тайная жизнь пчёл», которую мама хранила как талисман.
